科学运算,请远离INTEL

mooncocoon · 发表于 2007-4-19 12:39

实验室刚买的XENO5355*2的服务器,用来跑K原子级别的大体系分子动力学模拟,花了5W多,换来了什么呢~?
对比是实验室去年年初花2W多买的双OP265的机器
同样的2003的系统,同样的MS软件,同样的分子动力学大体系摸拟运算,同样有DOM3,调用同样多的4G内存,INTEL这边运算过程调用8核,AMD那边调用4核,放在同一个房间,同时开始计算

11天过去了,AMD组第3组大体系的分子动力学计算已经接近完成,INTEL那边第一组还没有完成…… 察看纪录,双方的CPU调用全都是100%

不明原因,但我到得出了一个结论——物理模拟以及量子物理方面的运算~请远离INTEL……

hdy_aoe · 发表于 2007-4-19 12:41

这里几个搞科学计算的？？

mooncocoon · 发表于 2007-4-19 12:42

所以我才没让所有人远离INTEL嘛~

Prescott · 发表于 2007-4-19 12:43

w00t) 这么说5355 x2 连 OP 265 *2的1/3性能都不到？
我看你还是需要仔细找一下原因的。

而且5355 x2 怎么需要5万块钱？

mooncocoon · 发表于 2007-4-19 12:48

整机需要5W，买U的时候被狠宰了一把，一快1W2

找了几天时间的原因了，没有头绪，计算模型~调用内存数~计算量设置~操作系统全部一样，AMD这边的系统还要老整整1年……

事实让人崩溃，除非你打算跟我说2003现在还不能很好的支持XENO5355或者需要补丁什么的 ……

mooncocoon · 发表于 2007-4-19 12:49

总之因为这个，实验室采购安腾2集群服务器的计划被搁置了，再卖一个OP8系列的服务器的计划被提上来了

只看该作者 · 发表于 2007-4-19 12:50

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kknd1967 · 发表于 2007-4-19 12:51

效率差了6倍/core，又不是mp扩展性的问题
搞研究的不明原因如何结论？ :huh:

mooncocoon · 发表于 2007-4-19 12:56

我现在估计跟DOM3有关，根据经验DOM3做势分析需要异常频繁的内存读写
可是不挂DOM3，还模拟个毛的体系啊……

之前算了个小体系的，50原子，势环境相对2000的体系已经是简单的不能再简单了，那次大家平手算是，都是9小时左右完成，OP265这边快了20多分钟

只看该作者 · 发表于 2007-4-19 12:58

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无梦之夜 · 发表于 2007-4-19 13:01

渣.......不过桌面平台肉还是很好的:a)

Edison · 发表于 2007-4-19 13:12

去cpuid那里下个PerfMonitor，然后看看都是些什么指令为主。

不过如果是内存操作密集型的应用，CPU200X的FP rate就是答案了。w00t)

roland2kw · 发表于 2007-4-19 13:12

楼主你哪里的？整机是哪家的产品？有必要CALL SUPPORT。

gazel · 发表于 2007-4-19 13:28

可以用VTune看看，看看瓶颈在哪里。用的是什么编译器？你的结果真的很奇怪。

zaarath · 发表于 2007-4-19 13:32

这个差距也太大了点吧，2.66 * 8 = 21.3 竟然不到 1.8*4 = 7.2的三分之一，就是说效率差了将近九倍。core 2 又不是当年netburst的低效率，即使在科学计算上没什么优势也不可能一败涂地。毕竟同频的话science mark和F@H都是conroe胜出。

你要是搞科研的，如此大的反差肯定会引起你的警觉，知道肯定是哪里不对劲。

你应该先用一些常用测试软件（尤其是支持多核的比如cinebench）来确定xeon的机器肯定是运行正常。
然后你比较一下单线程运行的情况，再比较一下双线程，然后再试试4/8线程，结合不同的内存设定。如果还不行，打电话给供应商，让他们派人来解决。

不明原因，就下了结论，亏你是搞学术的。

zaarath · 发表于 2007-4-19 13:34

原帖由 Edison 于 2007-4-19 13:12 发表
去cpuid那里下个PerfMonitor，然后看看都是些什么指令为主。

不过如果是内存操作密集型的应用，CPU200X的FP rate就是答案了。w00t)

FP Rate差再多能差9倍么？我看是应该叫售后的时候了。

zaarath · 发表于 2007-4-19 13:39

还有就是大家说话小声点。AMD听到的话明天就会看到报道：

“Barcelona expects to see 10X gains in scientific applications"

89度热水 · 发表于 2007-4-19 13:42

让INTEL来解决吧，应该不是U本身的性能问题

mooncocoon · 发表于 2007-4-19 13:47

OYE~PerfMonitor弄来了，两边全都安装不能，03系统……

点PerfMonitor.exe,全无反映……

[ 本帖最后由 mooncocoon 于 2007-4-19 13:52 编辑 ]

mooncocoon · 发表于 2007-4-19 13:54

有在考虑换UNIX或者LINUX，不过这要征得ACCELRYS的同意……

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AlcatrazX 该用户已被删除	7^# 发表于 2007-4-19 12:50 \| 只看该作者提示: 作者被禁止或删除内容自动屏蔽
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potomac 该用户已被删除	10^# 发表于 2007-4-19 12:58 \| 只看该作者提示: 作者被禁止或删除内容自动屏蔽
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